质谱蛋白组学不依赖任何亲和试剂：蛋白被酶解成肽段，肽段依质荷比被测量，再由谱图反推序列与来源蛋白。这赋予了它"无偏"的潜力——不预设看哪些蛋白。代价是灵敏度：质谱仪测量的是离子，而单细胞样品连"装进管子不丢失"都是难题。
领域的回答分三层。样品层：把一切操作缩到纳升级，让吸附与稀释损失降到最低（2.1、2.4 节）；定量层：用等压标记把多个细胞装进同一次采集，并以载体通道放大信号（2.2、2.3 节）；采集层：让仪器更快地循环扫描，或改用数据非依赖采集提高一致性（2.5、2.6 节）。三层叠加，才有了今天单细胞数千种蛋白的深度。
2.1
皮克级的战争：单细胞样品制备的物理化学
表面吸附、稀释与污染三大敌人；损失发生在哪个环节、为什么体积是命门。
2.2
SCoPE-MS：等压载体策略
串联质量标签的多重定量原理；载体通道如何让单细胞肽段被鉴定，而定量仍来自单细胞。
2.3
SCoPE2：把流程做稳
窄孔柱、自动化细胞挑选与质量控制指标；方法学论文里真正值得学的东西。
2.4
nPOP：纳升级一步法与规模化制备
氟碳载玻片上的纳升级液滴；从一次一个细胞到一天三千细胞；与商品化平台的对照。
2.5
免标记与 DIA：多重标记之外的采集路线
免标记单细胞何时可行；数据非依赖采集的一致性优势；plexDIA 把多重标记引入 DIA。
2.6
仪器前沿：深度与通量的边界
新型质量分析器、离子淌度与自动进样如何把单细胞蛋白组推向数千种蛋白；成本账。