第6章 · 6.4

6.4 烯烃和环系的相对构型

Relative Configuration of Alkenes and Ring Systems
本页范围与学习目标
本节在连接结构和氢原子指认已建立的条件下,讨论双键及环系的相对构型。烯烃耦合首先约束目标氢的顺反关系,E/Z 则须另按 CIP 优先级命名;环系需分别记录取代基的上下关系和当前椅式的轴向、赤道向位置。通过教学设定的烯烃与环己烷例题,检验同一候选能否同时解释耦合和 NOE,并说明环翻转、构象平均及实验缺峰对结论的限制。
先读图解和核心解释;需要细节时再展开。
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由目标氢的关系推回取代基关系

氢之间的空间关系与取代基之间的空间关系要逐步对应。

由目标氢的关系推回取代基关系 步骤 1 固定观察对象 到底比较哪两个氢 先核对连接与标签 步骤 2 联合几何证据 耦合与 NOE 分别使用 检查候选环构象 步骤 3 再写相对构型 区分上下与轴赤道 记录成立条件 由目标氢的关系推回取代基关系 步骤 1 固定观察对象 到底比较哪两个氢 先核对连接与标签 步骤 2 联合几何证据 耦合与 NOE 分别使用 检查候选环构象 步骤 3 再写相对构型 区分上下与轴赤道 记录成立条件
图 6.4-1 本页概念关系图。箭头表示本页采用的检查顺序。

读图时保留这项条件:环翻转可以改变轴向和赤道向,但不会自动改变既定的上下关系。

6.4.1 先确定所比较的原子和描述符

本节以第5章建立的连接图,以及 6.1节的二面角分析、6.3节的 NOE 判读为先修。目标是在已知连接结构中比较立体候选。相对构型(relative configuration)规定两个或多个立体单元之间的关系。例如两个环上取代基同面或异面,就能区分顺式和反式;这项判断本身不要求确定每个手性中心的绝对构型。实际解题必须先写明比较对象,不能把一个氢与另一个取代基的关系,直接替换成两个取代基的关系。

展开说明与推导

双键两端各有一个氢时,跨双键的三键耦合约束这两枚固定编号氢之间的相对位置。所比较的对象应先写入指认表。

这里的顺反关系(cis/trans relationship)表示指定对象位于双键的同侧或异侧。E/Z 描述符(E/Z descriptor)则比较双键两端各自优先级较高的基团:同侧为 Z,异侧为 E。优先级由CIP 顺序规则(Cahn–Ingold–Prelog sequence rules)确定;最先比较直接相连原子的原子序数,若相同,再按规则逐层比较。对象选择和优先级排序都是命名步骤,不能由耦合大小代替(Favre、Powell,2013,P-91.2与P-92)。

定义

对于普通的 RCH=CHR′ 片段,R 和 R′ 都经碳原子与双键相连,因而各自优先于氢。两氢反式对应 E,两氢顺式对应 Z。这个对应关系依赖此处的取代拓扑。若一端没有氢,便没有这对跨双键氢的三键耦合;若一端连接两个相同基团,双键也不具有 E/Z 异构。

展开说明与推导

图 6.4-2右侧给出一个可逐原子核查的例子。2-溴丁-2-烯的两个甲基同侧,但在 C2 上溴优先于甲基,在 C3 上甲基优先于氢,高优先级基团分居异侧,所以该图是 E 构型。它只有一枚烯氢,不能套用“两枚烯氢的大耦合”规则。对于末端 CH₂=CHR,末端两氢之间是偕耦合;虽然它们可分别与另一端的氢发生顺式、反式三键耦合,整个末端双键仍没有 E/Z 标签。检查键数和原子编号可避免把这些耦合混为一项。

同侧对象的选择决定顺反表述;E/Z须另查优先级,结构均为原创示意 丁-2-烯酸甲酯:Z 丁-2-烯酸甲酯:E 2-溴丁-2-烯:E C2C3 C2C3 C2C3 H2H3 C1: CO2MeC4: CH3 H2H3 C1: CO2MeC4: CH3 BrH3 C1: CH3C4: CH3 H2/H3同侧;C1/C4同侧 H2/H3异侧;H2/C4同侧 甲基同侧;Br/C4异侧 示意:左两图的C1为羰基碳;Me表示甲基;右图仅有一枚烯氢
图 6.4-2 指定对象的顺反关系与 E/Z 命名。键线均连接到标出的双键碳;左两图用同一编号讨论 H2、H3 与 C4 甲基,右图显示“甲基顺式”不能普遍等同于 Z。
习题 6.4-1

使用图 6.4-2右图的编号:C2的上侧是Br、下侧是C1甲基;C3的上侧是H3、下侧是C4甲基。确定 E/Z,并说明能否通过烯氢之间的三键耦合验证它。若只把右端的 H3 与 C4 甲基对换,描述符如何改变?

参考解答

C2端比较直接相连的Br与C,Br优先;C3端比较C与H,C4甲基优先。高优先级的Br在上、C4在下,原图为E。C2没有氢,只有H3一枚烯氢,不能测得所需的跨双键氢—氢三键耦合。对换右端两基团后,Br与C4都在上侧,构型为Z;此时两甲基异侧。可利用合适甲基与H3之间的空间相关检验候选,但须处理甲基转动与实验串扰。

6.4.2 烯烃:耦合判断目标氢,NOE 检查空间关系

普通非张力烯烃的反式跨双键氢—氢三键耦合,通常大于相应顺式耦合。这是同类片段的经验规律,取代基、键角及特殊电子结构会改变数值;不宜用一个固定阈值覆盖全部烯烃。双键使局部几何受到限制,因此这项耦合通常比柔性单键上的三键耦合更直接地约束目标氢的关系。这里仍须确认所读数值确实属于指定两氢:先用 COSY 和连接指认定位,再检查二阶效应,必要时采用选择性去耦或全谱拟合(Reich,资料集“烯烃耦合”;Nowick,2020,Lecture 14)。

展开说明与推导

以图中丁-2-烯酸甲酯为教学例,C1是羰基碳,C2与C3为双键碳,C4为末端甲基。设已用 HSQC、COSY 及 HMBC 确认 H2、H3 与 C4甲基的指认,并可靠提取 \(^{3}J_{\mathrm{H}_{2},\mathrm{H}_{3}}=15.5\,\mathrm{Hz}\)。这里的数值为题设参数。首先,它支持两氢反式;随后检查 CIP:C2端的C1基团优先于H2,C3端的C4优先于H3。因此,两氢反式使C1与C4也呈异侧,得到E候选。命名结论在原子关系已确定之后产生。

该E候选还预测 H2 与 C4甲基位于双键同侧。设短混合时间的选择性 NOE 实验中,照射H2可观察到C4甲基的可重复响应;对照证实照射带宽没有覆盖甲基信号,也没有覆盖H3。这一响应与E图中的空间接近相容。Z候选把H2和H3放在同侧,同时把H2与C4分置异侧,需面对耦合和空间预测的共同检验。取代基的转动会改变具体氢—氢距离,所以“同侧”提供的是几何倾向,不能直接赋予固定 NOE 强度。

若 H2/H3 的 NOE 未被检出,只能记录为在给定条件下低于检测水平。重叠、弛豫条件和有限灵敏度都可能使相关不可见。此例的支持来自已识别的大耦合与受控的H2—甲基空间响应,缺峰只作补充。反过来,若得到与Z相容的空间相关,却仍读出较大的反式耦合,应先检查指认、第二组分和NOE伪影。不能保留一个候选的J解释,再借另一个候选解释NOE。

6.4.3 环系:上下关系与轴向、赤道向分别记录

环己烷椅式中的轴向(axial)与赤道向(equatorial)描述当前构象中的键方向。六根轴向键近于相互平行,相邻位置交替向上、向下;同一碳上的赤道向键与轴向键分居两面。“上、下”用来标记环的两面,不以纸面文字的高低定义。两个指定取代基同为上或同为下是顺式,一上一下是反式。这项顺反关系要结合它们所在的环位置判断。

展开说明与推导

环翻转(ring flip)使每根轴向键变为赤道向、每根赤道向键变为轴向,但指定取代基的上、下关系保持。于是一个上方甲基可从轴向上变为赤道向上;它不会在翻转中成为下方甲基。判断构型时,应给原子保留固定编号,将a、e作为随构象变化的属性。否则,翻转前后的“轴向氢”可能指不同原子,不能直接放进同一张实验相关表(Favre、Powell,2013,P-94;Reich,环系耦合资料)。

表6.4-1可从轴向方向交替这一条件推得。例如选定C1轴向向上,则C2轴向向下、C3轴向向上、C4轴向向下。C1与C2均轴向时,两取代基异面,属于反式;两者均赤道向时方向同时反转,仍是反式。C1与C3均轴向时,两者同面,属于顺式。位置差改变了顺反对应,所以“两个取代基都赤道向”不能单独回答顺反问题。

表6.4-1 普通环己烷椅式中取代基位置与相对构型
取代位置同类位置:a,a或e,e混合位置:a,e或e,a翻转保持的性质
1,2反式顺式取代基同面或异面
1,3顺式反式取代基同面或异面
1,4反式顺式取代基同面或异面
展开说明与推导

这张表只适用于所述椅式。五元环的起伏、桥环约束和明显扭曲的六元环不能直接套入。稠环还要区分单个环的取代关系与环并合关系;即使某些氢位于同面,也需说明它们是哪一对环并合氢。对于未知环系,先检查环大小与连接拓扑,再决定能否使用椅式模型。模型不适用时,应比较候选实际允许的二面角和距离,而不强行给每枚氢贴a或e标签。

习题 6.4-2

参考椅式中C1轴向向上,轴向方向沿环交替。三个独立结构分别为:①C1、C2取代基均赤道向;②C1、C3取代基均赤道向;③C1赤道向、C4轴向。逐项给出两个取代基的上下方向和顺反关系,并写出翻转后的a/e位置。

参考解答

C1、C2、C3、C4的轴向方向依次为上、下、上、下;同碳赤道向方向相反。①C1e向下、C2e向上,是反式;翻转为C1a向下、C2a向上。②C1e向下、C3e向下,是顺式;翻转后均为轴向下。③C1e向下、C4a向下,是顺式;翻转为C1a向下、C4e向下。三个结构的方向关系均不变,只有a/e属性改变。

6.4.4 环己烷实例:从观察氢推回取代基

椅式中相邻的两个轴向氢,其 H—C—C—H 二面角接近反式共平面(antiperiplanar)区域,通常产生较大的三键耦合;轴向—赤道向及赤道向—赤道向组合通常较小。这个倾向来自二面角与耦合的关系,具体数值还受取代基和环形变影响。观察到某甲次氢具有两个较大的邻位耦合,可支持它在优势椅式中为轴向;与它同碳的取代基则为赤道向。必须完成最后这一转换,不能将氢的位置误写成取代基的位置(Karplus,1963;Nowick,2020,Lecture 14)。

展开说明与推导

考虑C1连甲基、C4连叔丁基的环己烷,编号只按本例固定。设分析已支持叔丁基主要处于赤道向,且普通椅式足以描述优势构象。为作图,任意规定C4叔丁基向下,则H4轴向向上。此时C1、C3、C5的轴向方向均向下,C2与C6的轴向方向向上。图 6.4-3画出反式候选:C1甲基赤道向上,H1轴向向下。图中的上、下选择是几何参考,整个分子转向不会改变反式关系。

反式1,4取代环己烷的两个椅式:环翻转保持Me上和tBu下;原创几何示意 优势椅式:Me(e),tBu(e) 翻转椅式:Me(a),tBu(a) 123456 123456 环翻转 H1:下,aH4:上,a H1:下,eH4:上,e Me:上,etBu:下,e Me:上,atBu:下,a 示意:数字为环碳编号;a/e随翻转互换;Me上、tBu下的反式关系保持
图 6.4-3 同一反式1,4取代环己烷的环翻转。左图H1与H4均轴向,所连取代基均赤道向;右图二者交换a/e属性,上下关系和所有原子编号保持。优势构象是本例的分析前提,图中未给出实验构象比例。
展开说明与推导

现给教学数据:H1与C2、C6各一枚已指认氢的三键耦合分别为11.2和10.8 Hz,另外两项邻位耦合较小;H4也具有与两侧相邻轴向氢相容的较大耦合。先由连接网络确认前两项分别跨C1—C2及C1—C6,排除将偕耦合误纳入。H1的两项大耦合支持轴向向下,因此C1甲基赤道向上。C4叔丁基向下,两个取代基异面,支持反式候选。若为顺式且叔丁基仍为赤道向下,C1甲基必须轴向向下,H1变为赤道向上,难以解释该组耦合。

此处只比较跨相邻环碳的四项耦合。H1与所连甲基氢之间还可有三键耦合,须另作指认,不能把它当成H1的第三个轴向邻氢。C2等位置的两氢也须通过连接和整个耦合网络区分;如果仅因它与H1有NOE便先叫它“轴向氢”,再用这条NOE证明H1轴向,推理会循环。没有独立标签时,可以先用H2a、H2b这样的中性编号,等候选通过整组数据检验后才附上构象位置。

空间证据需在同一个椅式里核对。设短混合时间下,H1与C3、C5的向下轴向氢均出现可重复的NOE;H4与C2、C6的向上轴向氢也有响应。这两组1,3轴向空间接近,与反式候选的两面分布相容。这里“轴向氢”是候选优势构象中的位置说明,实验记录仍应保留每枚氢的固定编号。顺式候选使H1向上,不能在保留同一优势椅式的同时解释H1与上述向下氢的空间接近。结论应写成“支持两取代基反式及所示优势椅式”,不把它扩展为普通非手性介质中的绝对构型指认。

方法

先固定连接图和原子标签,再为每个立体候选写出允许的椅式。逐项列出观察氢的邻位耦合对象、同碳取代基的位置及预期空间接近。一个候选只有在这些预测可以同时成立时才保留;若需要构象混合,J与NOE必须使用同一组构象及其占比。

6.4.5 构象平均、矛盾证据与补充实验

柔性环系的J值可能反映构象平均(conformational averaging)。在交换足够快、能够提取相应标量耦合的近似下,同一对固定编号氢的观测耦合可写为占比加权平均。这里必须平均同一对原子,不能把每个构象里重新挑选的“轴向氢”作为同一核。若有明显交换展宽或强耦合,先检验提取方法,再使用平均模型。交换时间尺度将在6.7节展开。

展开说明与推导
\[J_{\mathrm{obs}}=\sum_k p_kJ_k,\qquad \sum_k p_k=1\]
(6.4-1)

式中 \(p_k\) 是第 \(k\) 个构象的无量纲占比,\(J_k\) 是同一原子对在该构象中的耦合,\(J_{\mathrm{obs}}\) 是观测有效耦合,后两者均以Hz表示。NOE不能用平均距离直接代入静态关系;在适当的运动模型下,交叉弛豫对短距离具有更大的权重。一个占比较低但使两核靠近的构象,也可能影响空间响应。因此,中等J与较强NOE并不自动矛盾,需要检验同一构象系综能否给出两者(Claridge,2016)。

缺乏唯一结论时,应保留候选和可检验差异。例如两种双键候选只在一对重叠信号的NOE上不同,可先改善分辨率或改用选择性一维实验;两种环候选在某个已指认甲次氢的邻位耦合上不同,可选择去耦或拟合以获得该参数。延长混合时间后才出现的远端相关,须检查自旋扩散,不能直接增加为一条构型约束。对于环翻转明显的体系,温度变化可帮助检验优势椅式假设,但具体动力学解释留到6.8节。

警示

NOE响应支持给定实验条件下的空间接近,单个未检出相关通常不足以排除候选。耦合约束二面角,NOE约束空间几何;当二者无法由同一候选解释时,检查指认、重叠、交换与构象假设。不能分别改变环方向或氢标签来消除矛盾。

展开说明与推导

报告中应区分已经测得的参数、采用的构象前提和据此支持的构型。例如写明某对氢的J由拟合得到,哪组NOE在短混合时间可重复,叔丁基赤道向是否有独立依据,以及是否仍存在其他允许构象。若CH₂两氢尚未分开指认,只能先把相关定位到该碳的氢集合;具体原子指认将在6.5节继续。保留这些标签和条件,后续实验才能逐项复核现有结论。

习题 6.4-3

某立体候选允许构象A、B快速交换,固定编号的一对氢在A、B中的教学设定耦合分别为11.0、3.0 Hz,观测有效耦合为8.0 Hz。在同一简化弛豫模型下,一组固定原子对的初始交叉弛豫参数分别为 \(\sigma_A=2.00\,\mathrm{s}^{-1}\)、\(\sigma_B=0.200\,\mathrm{s}^{-1}\),且题设允许按占比线性平均。求A占比及预期平均参数,结果保留两位小数。若观测为 \(1.33\,\mathrm{s}^{-1}\),能否认为它与J相容?能否据此证明候选唯一?

参考解答

令A占比为 \(p\),则 \(8.0=11.0p+3.0(1-p)\),得 \(p=5/8=0.625\),B占比为0.375。同一占比预测 \(\sigma_{\mathrm{obs}}=0.625\times2.00+0.375\times0.200=1.325\,\mathrm{s}^{-1}\),四舍五入到两位小数为 \(1.33\,\mathrm{s}^{-1}\),与所给观测相容。这里没有分别为J和NOE选取两组占比。相容只说明该候选通过两项检验;其他候选若也给出相同预测,仍需能区分它们的参数。题设的线性弛豫平均仅用于这道简化算例,不能把任意NOESY峰强度直接代入。

关键术语

相对构型 (relative configuration)
指定立体单元之间的关系,不要求由此确定各中心的绝对构型。
顺反关系 (cis/trans relationship)
指定对象在双键同侧、异侧或环的同面、异面关系。
E/Z描述符 (E/Z descriptor)
比较双键两端高CIP优先级基团,异侧为E、同侧为Z。
CIP顺序规则 (CIP sequence rules)
依原子及配体信息排序,用于指定立体描述符的一组规则。
轴向 (axial)
椅式中近于平行轴方向的键位置,随环翻转变为赤道向。
赤道向 (equatorial)
椅式中向环周缘伸展的键位置,与同碳轴向键分居两面。
环翻转 (ring flip)
椅式之间的构象变化,交换a/e属性并保持指定取代基的上下关系。
构象平均 (conformational averaging)
运动使观测参数反映构象系综,不同参数须采用相应的平均模型。

参考文献与延伸阅读

  1. Favre HA, Powell WH(编). 2013. Nomenclature of Organic Chemistry: IUPAC Recommendations and Preferred Names 2013. Royal Society of Chemistry. IUPAC在线章P-9:构型与构象的指定。
  2. Reich HJ. 年份未标. NMR Info/Data — Hans Reich Collection. University of Wisconsin–Madison;ACS Division of Organic Chemistry维护. 现行资料入口。烯烃与环系耦合条目用于一般规律;2017旧版PDF已标明不再维护。
  3. Karplus M. 1963. Vicinal Proton Coupling in Nuclear Magnetic Resonance. Journal of the American Chemical Society, 85: 2870–2871. doi:10.1021/ja00901a059。
  4. Nowick JS. 2020. Chem 203: Organic Spectroscopy. University of California, Irvine. 官方课程;本节相关内容为Lecture 14的耦合与立体化学及Lecture 20的NOE。
  5. Claridge TDW. 2016. High-Resolution NMR Techniques in Organic Chemistry, 3rd edition. Elsevier. 出版社书目与目录。