第6章 · 6.10

6.10 糖类与天然产物

Carbohydrates and Natural Products
本页范围与学习目标
从异头中心和糖残基指认出发,用计数、连接相关与空间证据分别检验糖苷连接和天然产物构型,明确构象假设及数据库比对的边界。
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糖和天然产物先连接,再讨论立体

异头中心的局部判据必须放回具体糖构型与环构象中使用。

糖和天然产物先连接,再讨论立体 步骤 1 认清局部片段 糖残基、官能团和环 逐项闭合氢碳计数 步骤 2 确定连接位置 内部网络与糖苷连接 用合适的二维关系 步骤 3 判断相对构型 结合环构象、耦合和 NOE 限定绝对构型证据 糖和天然产物先连接,再讨论立体 步骤 1 认清局部片段 糖残基、官能团和环 逐项闭合氢碳计数 步骤 2 确定连接位置 内部网络与糖苷连接 用合适的二维关系 步骤 3 判断相对构型 结合环构象、耦合和 NOE 限定绝对构型证据
图 6.10-1 本页概念关系图。箭头表示本页采用的检查顺序。

读图时保留这项条件:大耦合不普遍等同于某个异头命名,连接和绝对构型需分开报告。

6.10.1 在多官能团分子中保持证据层次

糖类与天然产物常同时含有多个含氧位点、立体中心和相互重叠的氢信号。前面学到的位移、耦合与相关谱在这里仍然适用,但每一次结构判断需要对应到固定的原子编号。先确定哪些原子相连,再判断立体中心的相对关系,最后处理绝对构型和构象。连接结构确定后,立体问题可能仍然开放;同一种连接结构也可能在溶液中出现多种构象。

展开说明与推导

本节以已学的 COSY、HSQC、HMBC 和 NOE 为基础,练习把复杂分子拆成能够检查的小片段。Duus、Gotfredsen 与 Bock(2000)系统讨论糖结构的 NMR 方法及其限制;其分析思路包括先完成残基内部指认,再确定残基之间的连接。天然产物中也可采用这种逐片段推进的办法,不过支链、季碳和融合环常使连续的氢耦合网络中断。

同一张谱图上的多个接近峰不必属于同一片段。含氧碳上的氢可能集中在相似位移区域,二阶效应又可能掩盖真实耦合。应以交叉峰的两个坐标登记候选连接,用 HSQC 区分重叠氢对应的碳环境,遇到多个可能归属时保留分支。把最显眼的一条线当作全部氢的代表,容易使后面的计数、耦合与空间证据同时偏离。

方法 · 三张独立记录表

连接表记录原子编号及成键证据,立体表记录可区分的构型候选及 J、NOE 约束,条件表记录溶剂、温度、交换和构象假设。每一项结论标明它依赖哪一张表;后续补实验时可直接检查受影响的推断。

6.10.2 异头中心需要结合环构象判断

单糖形成环状半缩醛或半缩酮时,原羰基碳成为异头碳(anomeric carbon),可能产生两种异头构型。α、β 描述异头中心相对参照构型的关系;D、L 描述另一套构型分类,R、S 则按序列规则命名具体中心。三组符号不能互换。糖的 α、β 也不能由某一峰向高场或低场移动独立命名。

展开说明与推导

以已知为 D-葡萄糖、采用 \(^{4}C_1\) 椅式构象的吡喃糖环为教学例。β 异头体的异头羟基为赤道向,H1 为轴向;H2 同样为轴向,因此 H1—H2 的三键耦合对应近似反式双轴关系。α 异头体的异头羟基为轴向,H1 为赤道向,H1—H2 的关系不同,耦合通常较小。这一推理同时使用了糖种、编号、构型与椅式构象,不能省略前提后推广到全部糖。

固定四C一构象下α的H1为赤道向,β的H1与H2均为轴向α-D-葡萄吡喃糖H1:赤道向H2:轴向H1—H2 耦合:通常较小β-D-葡萄吡喃糖H1:轴向H2:轴向H1—H2 耦合:通常较大教学前提:糖种与 D 构型已知,环采用 ⁴C₁ 椅式先识别糖种和构象,再用局部耦合比较异头体
图 6.10-2 固定构象下的异头耦合推理示意。图用方向表代替不完整的透视结构;它不适用于未经确认糖种与环构象的任意糖。
展开说明与推导

甘露糖在 C2 的构型与葡萄糖不同,相同椅式前提下 H2 的方向也随之改变,刚才用于葡萄糖的“大耦合对应 β”捷径便失去普适性。呋喃糖的环更灵活,局部二面角还会随构象改变。应沿 H1、H2、H3 等路径检查完整耦合模式,结合空间相关或其他资料确认环模型。单一耦合对角度的限制可能有多解,不能自动给出绝对构型。

游离还原糖的异头中心可经开链形式互变,溶液组成逐渐达到平衡,这种变旋(mutarotation)可使 α、β 两套信号同时出现。它们应有相应的残基指认和积分总量,不能把两套峰直接解释成杂质。异头中心转为糖苷键后,常规变旋途径受到限制;是否发生水解或其他交换,应由条件和时间变化判断。

警示 · 两套峰不直接等于两种杂质

先检查两组异头信号是否分别连入合理的同糖耦合网络,积分相加是否符合一个残基,放置时间和温度是否改变比例。峰组对应成立时再讨论变旋;只有峰数增加而缺少对应关系,不能据此命名异头体。

习题 6.10-1 · 异头耦合的前提

已知样品为 D-葡萄吡喃糖,主要采用 \(^{4}C_1\) 椅式。两个异头体的 H1—H2 耦合一大一小,如何初步指认?若糖种改为未知,还能照用吗?

参考解答

在给定前提下,大耦合支持 H1、H2 反式双轴的 β 异头体,小耦合支持 H1 赤道向的 α 异头体。需用残基内完整指认复核。糖种未知时,H2 方向和环构象均未确定,不能只按大小命名 α、β;应先识别糖种并检验构象。

6.10.3 从残基内部走向糖苷连接

对一个葡萄吡喃糖残基,可从已识别的 H1 出发,用 COSY 逐步追踪 H1—H2—H3—H4—H5,再到 H6a、H6b。真实谱中某一步可能重叠或很弱,TOCSY 可补充同一耦合网络的归属,但其远端相关不是直接相邻键的证明。将每个氢对应到 HSQC 中的 C1 至 C6 后,再检查碳数、氢数和含氧环境是否一致。

展开说明与推导

闭环葡萄糖的 C1 至 C5 各有一个碳连氢,C6 是亚甲基,共有七个碳连氢,尽管只有六个碳。分子式 \(\mathrm{C_6H_{12}O_6}\) 的其他氢可分配到五个羟基。羟基峰在某些溶剂和交换条件下难以观察,七个清晰的碳连氢并不与十二个总氢矛盾。两个异头体若同时存在,会把同一个原子编号分成两套对应信号,不能把十二个碳峰直接当成十二碳化合物。

连接两个已指认糖残基时,要确定提供异头碳的残基与接受取代的羟基位置。例如教学候选 A-(1→4)-B,可以检查 A 的 H1 与 B 的 C4 之间是否有符合糖苷路径的 HMBC,以及 B 的 C4 是否显示与相同条件参照相容的取代位移。A 的局部耦合和空间相关再用于 α、β 判断。互相补充的证据比仅凭某一个含氧碳的位移更可靠。

HMBC 是否出现取决于长程耦合、实验优化和信噪比。一个预期交叉峰缺失,不必立即排除糖苷连接;反过来,重叠区的一个交叉峰也可能有多个坐标归属。应列出替代连接如 1→3 或 1→6,比较它们对多个报告核和相关路径的预期。在连接位置尚未确定时,直接给完整寡糖名称会把未解决的推断隐藏在命名中。

异头中心为季碳的糖,以及脱氧糖、氨基糖等变体,需要调整起点和计数。常规质子检测的 HSQC 无法给不带氢的异头碳一个直接相关,这时可借助碳谱和长程相关。糖种判断还需把甲基、亚甲基、含氧次甲基及其他官能团一并解释;一片密集的含氧氢区域只能提示分析方向,不能单独证明某个单糖。

再检查一个由两个葡萄糖残基脱水形成的教学二糖。分子式为 \(\mathrm{C_{12}H_{22}O_{11}}\),不饱和度为二,与两个闭环残基相容。每个残基仍有七个碳连氢,总计十四个;八个剩余羟基提供另八个氢。供体的异头羟基参与糖苷形成,受体连接位置的羟基失去氢,两者与脱去一分子水的计数一致。这种核对还不能指定连接在受体哪一个位点,因为多个位置异构体保留相同分子式。

若受体的异头中心仍为游离半缩醛,它可以变旋;供体已经形成的糖苷异头中心则不因这个过程自动改变构型。因此观测到两套受体异头峰时,应分别追踪受体内部网络,再看供体信号是否受近邻环境影响而分开。不能把受体的两套峰误写成糖苷键同时具有两种构型。该例把化学交换、原子数和连接层级联系起来,也说明分析时必须区分每个残基的异头中心。

6.10.4 用完整计数约束天然产物骨架

天然产物的名称常引导直觉,结构证据仍需从分子式和编号出发。考虑一个明确标为教学设定的 \(\mathrm{C_{10}H_{20}O}\) 样品。忽略不适用元素后,不饱和度为 \((2\times10+2-20)/2=1\)。若碳谱没有可靠的烯烃或羰基证据,一个环是相容候选;仅凭分子式尚不能证明存在六元环。

展开说明与推导

试检验一个薄荷醇式连接候选:2-异丙基-5-甲基环己烷-1-醇。环上 C1、C2、C5 为 CH,C3、C4、C6 为 CH₂;异丙基含一个 CH 和两个 CH₃,C5 上另有一个 CH₃。合计四个 CH、三个 CH₂、三个 CH₃,正好十个碳;碳连氢为 \(4+3\times2+3\times3=19\),加一个 OH 得二十个氢。一个环贡献一个不饱和度,计数闭合。

四个CH三个CH2三个CH3合计十碳十九个碳连氢,另一个羟基氢教学候选:2-异丙基-5-甲基环己烷-1-醇环上 CH:C1、C2、C5环上 CH₂:C3、C4、C6支链:一个 CH、三个 CH₃碳:4 + 3 + 3 = 10C—H:4 + 6 + 9 = 19另有 OH:总氢 20计数成立 → 继续检查 COSY、HSQC、HMBC连接相容 → 另外比较 J 与 NOE 的立体约束
图 6.10-3 原创计数核对示意。此处只检验一个候选连接的分子式相容性,未声称得到实测薄荷醇谱或确定其构型。
展开说明与推导

随后需要实际成键证据支持环链、支链位置和含氧位点。一个含氧 CH 支持醇位点,但与其相邻的 COSY 路径、支链甲基对应的网络以及跨季碳的长程相关,决定具体连接。若另一个连接异构体具有相同碳类型计数,它同样会通过上述算术检查;计数的价值是排除不相容候选,保留相容者接受下一轮检验。

这个例子还说明积分和峰数的区别。三个甲基包含九个氢,却不必出现三个互不重叠的单峰;耦合可产生多条谱线,异丙基的两个甲基也可能处于不同环境。三个亚甲基的六个氢可能成对不等价。登记时按原子或氢位点分配,积分归一化按总量核对,避免拿多重峰内谱线数代替结构中的氢数。

习题 6.10-2 · 碳类型计数

教学候选有四个 CH、三个 CH₂、三个 CH₃,只有一个氧且无碳碳多重键。它能否与 \(\mathrm{C_{10}H_{20}O}\) 相容?还缺什么证据?

参考解答

碳数为十,碳连氢十九;把氧作为 OH 时补一氢,总氢二十。不饱和度一,在无多重键前提下需要一个环。该计数与环醇候选相容,但不能确定环大小、支链位置和构型。需相邻耦合网络、碳氢对应、长程相关以及独立立体证据。

6.10.5 稠环与空间相关分别约束什么

在稠环体系中,两个环共用一条键,桥头位点及其附近氢的方向限制了整体构象。先用连接证据确认共享的两个原子,再提出顺式或反式融合等相对构型候选。对每个候选画出完整的三维关系,检查可测耦合和可接近核对。只在平面结构中把两个桥头氢画到纸张同侧,并不构成空间证据。

展开说明与推导

若一个 NOE 支持某桥头氢与已指认甲基接近,它约束的是这个核对在样品条件下的距离和运动平均。需要把它放回完整融合环候选,检验是否与其他接近关系共同相容。NOE 缺失也可能由峰重叠、低信噪比或弛豫条件造成,不能直接换成“两个氢处于异面”。柔性稠环尤其要沿用上一节的系综考虑,避免强制所有观测属于同一个瞬时几何。

定义 · 相对构型的镜像边界

一组 J 和普通非手性介质中的 NOE 可以帮助排除相对构型候选,整体镜像通常仍保留同样的常规 NMR 关系。确定绝对构型需额外的手性依据,或与可靠的已知构型参照建立关系,并明确这一步的来源。

展开说明与推导

文献比对时,先核对编号映射,再比较条件。天然产物数据库中的相同名字可能对应不同盐形式、溶剂、立体表示或指认版本。NP-MRD 的数据协议区分实验数据与预测、模拟等资料;引用某条记录前,应保留类型标签并检查它提供的是原始数据、处理谱还是峰表。预测条目与当前预测吻合不能算两条独立实验支持。

最后的结构报告可以写成可检查的三段判断:哪些 COSY、HSQC、HMBC 支持某个连接;哪些耦合和空间关系排除哪些相对构型;绝对构型依据是否充分。对暂时未分配的氢和不能区分的构型保留编号与候选,不以天然产物名称代替证据。下一节把相同思路用于杂环、肽及大环,其中质子化、酰胺转动和更大的构象自由度会增加条件依赖。

习题 6.10-3 · 报告结论的范围

稠环候选的连接已确定,若干 J 与 NOE 支持其中一种相对构型。所有实验在非手性溶剂中完成,无已知手性参照。报告应怎样表述?

参考解答

报告连接结构、支持的相对构型、各条立体证据及构象前提,同时说明整体镜像尚未区分。不能只凭这组常规数据给唯一绝对构型。若引用数据库名称,还应核对记录是否实验、条件是否可比,避免把名字中的立体标签当作新的观测。

关键术语

异头碳 (anomeric carbon)
成环时由原羰基碳形成的半缩醛或半缩酮中心。
异头体 (anomer)
仅在相应异头中心构型不同的一类糖立体异构体。
变旋 (mutarotation)
游离还原糖异头体互变伴随的旋光变化。
糖残基 (sugar residue)
在寡糖等结构中作为独立编号单元的糖片段。
糖苷连接 (glycosidic linkage)
涉及异头中心、需说明连接位置与构型的连接。
稠环 (fused rings)
两个环共用一条键及其两个端点的环系。
桥头位点 (bridgehead site)
环系中参与环连接、具有特定拓扑关系的位点。
相对构型 (relative configuration)
多个立体中心之间的构型关系,可能保留整体镜像歧义。

参考文献与延伸阅读

  1. Duus JØ, Gotfredsen CH, Bock K. 2000. Carbohydrate Structural Determination by NMR Spectroscopy: Modern Methods and Limitations. Chemical Reviews, 100: 4589–4614. 糖结构解析方法。
  2. Varki A, et al., editors. 2022. Essentials of Glycobiology, 4th edition,Monosaccharide Diversity. Cold Spring Harbor Laboratory Press. 糖构型和结构背景。
  3. Claridge TDW. 2016. High-Resolution NMR Techniques in Organic Chemistry, 3rd edition. Elsevier. 二维与立体证据。
  4. Nowick J. 2020. Chem 203: Organic Spectroscopy. University of California, Irvine. 复杂结构分析课程。
  5. NP-MRD team. NP-MRD Data Protocols. 天然产物资料的类型和指认协议,访问日期 2026-10-11。