乙酸乙酯可以画成展开式、缩写式或骨架式,省略的符号不同,原子连接应当相同。解谱记录还会给这些原子编号,再把信号对应到具体位置。本节沿这一过程说明,怎样核对结构图,怎样建立标签映射,以及画法或编号改变时必须保留哪些化学信息。
1.6.1 换一种画法,连接关系仍须保持
展开式把原子与化学键逐一画出,缩写式把同一位置的氢合写成 CH3、CH2 等基团,骨架式则通常进一步省略碳符号和碳上氢。这些画法保留的核心是连接关系:哪些原子相连,相连的键是单、双还是三键。分子式只给元素总数,与这几种结构表示需要分别读取。
例如 CH3CH2OH 表示第一个碳连接第二个碳,再接氧和氧上氢;CH3OCH3 则把氧放在两个碳之间。两者都含两个碳、六个氢和一个氧,连接已经不同。分支也需要按括号位置读出:CH3CH(OH)CH3 中,OH 连接紧邻括号前的中间碳。抄写时保留总分子式,仍可能因为一根键或一个括号的位置而换成另一个结构。
骨架式的未标元素线端、折点和明确支化节点代表碳,O、N、卤素等按所标元素读取;随后依据已画的键与相应价态补回氢。每条线的中点不另增碳,环内空白也不增加原子。交叉线若没有明确说明相交处是否为节点,应重新绘图消除歧义。没有碳碳骨架的甲烷,直接写 CH4 比一个无标签的孤立点更清楚。
骨架式省略的碳上氢可以依据明确价态补回。电荷需要与价态及电子计数核对,同位素与立体构型需要相应标记。原图含 D、电荷或楔线时,改成简写式仍需保留这些信息,或明确注明当前表示没有指定哪一项。
1.6.2 对乙酸乙酯进行两遍核对
图 1.6-1 把乙酸乙酯画成三种形式。为追踪相同位置,本例将酰基端甲基碳记为 C1,羰基碳记为 C2,单键氧后的亚甲基碳记为 C3,末端甲基碳记为 C4;羰基氧记为 Oa,连接两个碳的氧记为 Ob。这些是本例的追踪标签,尚不涉及系统命名的编号规则。
第一遍只核对元素与连接。从 C2 看,它与 Oa 形成双键,与 C1、Ob 各形成单键;Ob 的另一端连接 C3,C3 再连接 C4。第二遍补氢:C2 的键级之和为四,不带氢;C1 与 C4 各只有一条重原子单键,各带三个氢;C3 已连接 Ob 和 C4,带两个氢。Oa 的双键与 Ob 的两条单键满足本例中性氧的二价,都没有 O—H。
对省略碳氢键的骨架式,可把补氢过程写成式(1.6-1)。其中 \(h_i\) 为第 \(i\) 个通常中性四价碳上尚未画出的氢数,\(b_{ij}\) 为它与已明确连接原子 \(j\) 之间的键级,\(H_{\mathrm C}\) 为本例全部碳上氢数。这里骨架式省略了所有 C—H,求和使用重原子之间的已画连接。
若某些氢已经显式画出并纳入键级求和,就不再把它们作为未画氢重复补入。对于本例,三、零、二、三的碳上氢数相加得到八,分子式为 C4H8O2。这项局部价态检查沿用通常中性四价碳的假设,不能直接应用于碳正离子、自由基或其他非常规电子结构。
先比较各元素总数,再逐原子检查邻接对象。乙酸乙酯若被抄成丙酸甲酯,总组成仍相同,单键氧所连的含氢碳却从 CH2 换成 CH3。单凭分子式通过,不能证明结构图被正确转写。
习题 1.6-1 找出补氢错误
有人把图 1.6-1 中 C1、C2、C3、C4 的氢数写为 3、1、2、3,并给 Ob 再添一个氢。请逐位修正,说明两处错误的原因。
参考解答C1、C3、C4 的计数保持 3、2、3。C2 已有一根双键和两根单键,键级总和为四,再添氢会超出本例碳的四价,因此应为 0。Ob 已与 C2、C3 各形成一根单键;若再添氢,便不能仍把它当作原图中的中性二价氧,原图也没有相应电荷标记。总氢数为 \(3+0+2+3=8\),分子式恢复为 C4H8O2。
1.6.3 标签说明指的是谁,不额外规定化学性质
原子编号为图中的位置分配可持续引用的标签。C1—C4 应在结构图、实验记录与指认表中保持一致;另一份资料若采用不同编号,需要根据连接位置建立映射。命名位次则是化学名称中按命名规则定位结构特征的符号,例如丁-2-醇中的“2”表示羟基所连的主链碳。本例给乙酸乙酯设置的 C1—C4 不能直接当作它的系统命名位次。
假设另一份记录从乙基末端反向编号,使用 B1—B4。对应关系为 C4→B1、C3→B2、C2→B3、C1→B4。核对时,C1—C2 单键变为 B4—B3,C2—Ob—C3 变为 B3—Ob—B2,C3—C4 变为 B2—B1;羰基仍连接原来的那个碳。标签改变,连接保持,才说明两份记录描述同一结构。
相连氢可以使用位置标签,例如 C1 上的氢集合记作 H-1,C3 上的氢集合记作 H-3。这里连字符后的数字指位置,左上角的 ¹H 则指核种,均不表示组内氢数。另列一栏写清 H-1 有三个氢、H-3 合计两个氢,可以避免按标签数字计算氢数。
若需分别追踪亚甲基的两个氢,可暂记为 H-3a、H-3b,并说明字母如何对应图中位置;空间归属需要另行取得证据。不同标签没有直接证明两个位置的化学位移不同,合用一个标签也没有直接证明氢等价。编号首先解决引用对象,对称性、运动和实验条件将用于后续的环境判断。
1.6.4 指认表怎样保留尚未解决的对应
指认是把观察到的谱学信息对应到结构位置。已有编号图后,可以先登记结构预期,再另列实验观察与对应依据。表 1.6-1 尚未使用任何实验谱图,三、零、二、三的氢数全部来自结构价态;它们不能被写成已经测得的积分。
| 碳标签 | 直接连接的非氢原子 | 氢标签与结构氢数 | 实验对应状态 |
|---|---|---|---|
| C1 | C2,单键 | H-1,3 H | 尚无观测值 |
| C2 | C1、Ob,单键;Oa,双键 | 无直接相连氢,0 H | 不设直接相连氢的信号栏 |
| C3 | Ob、C4,单键 | H-3,合计 2 H | 尚无观测值 |
| C4 | C3,单键 | H-4,3 H | 尚无观测值 |
设一个教学数据集给出三个互不重叠的信号 P、Q、R,相对氢数为三、二、三,并明确每个信号对应一个完整氢集合,候选仅限乙酸乙酯。表中只有 H-3 合计两个氢,因此 Q 可以对应 H-3;P 与 R 都对应三个氢,仅据数量还不能决定谁属于 H-1、谁属于 H-4。两行应先记录“P 或 R”,等待位移或连接证据补充。
这一匹配依赖题目给定的完整分组与无重叠条件,实际谱图的积分与重叠需要按实验检查。指认时既要从每个信号检查它被分配到哪里,也要从每个含氢位置检查是否已有观察支持。尚未解决的对应明确保留,可以发现重复分配、位置漏记以及把预测误写成观察等问题。
编号转换时,结构侧与实验侧必须同时更新。另一份资料说“Q 对应 B2 上的两个氢”,应先通过映射得知 B2 是本页 C3,再填入 H-3;直接按数字写成 H-2,会落到本页不带氢的羰基碳上。记录中应保留编号图与版本,使每次更新都能按相同连接回查。
习题 1.6-2 编号转换后的指认
已知另一份乙酸乙酯记录采用正文的 B1—B4 编号,并写“Q 对应 B2 上的 2 H”。本页能否直接把 Q 写入 H-2 一栏?另外,P 与 R 都对应 3 H,能否据此给它们确定唯一位置?
参考解答不能按数字直接对应。先查映射,B2 对应本页 C3,因此 Q 应记入 H-3;本页 C2 是羰基碳,没有直接相连氢。P 与 R 的组内氢数相同,仅能确定它们分别属于 H-1、H-4,不能确定哪一个属于哪一位置。记录两种可能并注明“仅依据相对氢数”,待补充证据后再更新。
1.6.5 楔线在连接之外增加了什么信息
缩写式 CH3CH(OH)CH2CH3 已经确定丁-2-醇的连接:中间碳连接甲基、乙基、羟基和氢。这四个基团不同,该碳在此构成一个手性中心,允许两种镜像排列。普通缩写式没有选定其中一种排列,图 1.6-2 则用楔线增加这一空间信息。
本节按 Brecher 的 IUPAC 约定读取线型:实楔从纸面指向读者,虚楔伸向纸面后方,楔形窄端位于所描述的立体中心;普通线给出纸面内的参照键。楔线仍附着于已有单键,不增加原子,也不提高键级。图中的直角、长度和纸面位置用于表达关系,并非实测几何比例。
重画时需要同时追踪四个基团。整张图在纸面内转动可保持其空间排列;固定甲基、乙基后,只交换 OH 与 H,就改变了这个中心的构型。实楔并不固定对应 \(R\),虚楔也不固定对应 \(S\),这些构型描述符还依赖基团优先顺序,具体方法将在 6.6 节介绍。
原资料没有指定四个基团的空间排列,就记录“构型未指定”。这既没有证明分子为平面,也没有说明两种镜像排列等量混合;后者称为外消旋组成。图中画出一种排列,同样不能单凭示意图证明真实样品的对映体纯度。
习题 1.6-3 哪些信息能够恢复
资料甲给出丁-2-醇的缩写式 CH3CH(OH)CH2CH3,资料乙给出图 1.6-2。两份资料分别能否确定总氢数、中央碳连接的四个基团以及选定的空间排列?甲是否说明样品为外消旋混合物?
参考解答两份资料都给出相同连接,碳上氢数依次为 3、1、2、3,再加 OH 的一个氢,总数为 \(3+1+2+3+1=10\)。两者也都能确定中央碳连接甲基、乙基、羟基和氢。甲没有给出这四个基团的选定空间排列,乙则用楔线指定了一种。构型未指定不等于两种对映体等量混合,因而不能从甲推出外消旋组成。乙只是结构示意,图本身也不能证明真实样品的对映体纯度。
因此,一份可追踪的结构记录至少需要说明连接、所采用的原子标签,以及是否指定电荷、同位素与空间排列。下一节将利用这些信息比较连接相同或不同的异构体,并判断给定实验条件能否把它们区分。
补充:把连接结构写成 SMILES
SMILES 用字符序列表示原子及其连接,是后续计算软件的一种输入记法。按 Daylight 官方文档,CCO 表示乙醇,COC 表示二甲醚;CC(=O)OCC 表示乙酸乙酯。括号中的 =O 连接前面的第二个碳,读到单键氧之后的两个碳才确认该侧是乙基。
同一连接可以有不同的有效字符串,例如 CCO 与 OCC 都表示乙醇。遍历顺序和解析后的软件原子索引,不自动等于本页编号或化学命名位次。导入后仍应检查连接、补氢核对分子式,再建立标签映射。普通连接字符串若没有指定构型,也不能恢复原图未提供的空间信息。
结构字符串保存结构表示,谱图文件、采集条件与指认依据仍需另行关联。后续第8章的数据与计算讨论会使用这种区别;当前可以同时保存编号图和结构文本,使另一位读者能够按连接重建对应关系。
术语索引
关键术语
- 连接关系 (connectivity)
- 原子之间的成键关系及相应键级。
- 展开式 (displayed formula)
- 显式画出原子和化学键的结构表示,本节包含所有氢。
- 缩写式 (condensed formula)
- 将某些原子合写成基团,同时保留可辨认的连接顺序。
- 骨架式 (skeletal formula)
- 通常省略碳符号及碳上氢,用线端与节点表达碳骨架。
- 楔线式 (wedge-and-dash representation)
- 用普通键、实楔键和虚楔键表达相对纸面的空间方向。
- 手性中心 (chirality center)
- 本节指连接四种不同基团、产生两种镜像排列的四面体碳中心。
- 原子编号 (atom numbering)
- 为追踪结构中的原子分配并持续使用的标签体系。
- 命名位次 (locant)
- 化学名称中按命名规则定位结构特征的符号。
- 指认表 (assignment table)
- 记录观测与结构位置的对应关系、依据及未解决歧义的表格。
- SMILES (Simplified Molecular Input Line Entry System)
- 用字符序列表示原子、键及可选立体信息的线性记法。
参考资料
参考文献与延伸阅读
- McMurry, John. 2023. Organic Chemistry, §1.12, “Drawing Chemical Structures”. OpenStax. 官方章节:展开、缩写与骨架表示。
- Brecher, Jonathan. 2006. “Graphical representation of stereochemical configuration (IUPAC Recommendations 2006)”. Pure and Applied Chemistry, 78(10), 1897–1970. DOI:楔线表示及避免歧义的约定。
- Daylight Chemical Information Systems, Inc. Daylight Theory Manual, Chapter 3, “SMILES — A Simplified Chemical Language”. 官方文档:原子、键、分支与可选立体信息,访问于 2026-10-11。
- Reusch, William H. Virtual Textbook of Organic Chemistry, “Nuclear Magnetic Resonance Spectroscopy”. Michigan State University;ACS Division of Organic Chemistry 托管。结构环境、积分与裂分的教学说明。
- Silverstein, Robert M.; Webster, Francis X.; Kiemle, David J.; Bryce, David L. 2014. Spectrometric Identification of Organic Compounds, 8th ed. Wiley. 出版社书目:结构鉴定中的多谱证据组织。